Revelado pelo Flamengo, Júlio César alcançou o posto de titular do Rubro-Negro no ano de 1997 após a saída de Clemer para o Internacional. No clube carioca, conquistou o tetracampeonato estadual e campeão da Copa Mercosul. Na Itália, venceu cinco campeonatos nacionais, uma Champions League e um Mundial de Clubes. Na seleção, foi convocado pela primeira vez em 2003 e disputou a Copa das Confederações daquele ano. Em 2004, tornou-se titular da Seleção comandada por Carlos Alberto Parreira. Com a amarelinha, conquistou a Copa América, no primeiro ano como titular. Na Copa de 2006 voltou ao banco de reservas e só voltou a ser titular após a competição, na Seleção já comandada por Dunga. Sob o comando de Mano Menezes, novamente o arqueiro deixou de ser o titular e só retornou com o técnico Luís Felipe Scolari.